- 1991년
1991. 11
맥류연구소 폐지
- 1994년
1994. 12
작물시험장 전작 1,2과 -> 전작과, 특용작물과 + 약용작물과 -> 특용작물과 호남작물시험장 -> 호남농업시험장, 영남작물시험장 -> 영남농업시험장, 목포지장 -> 호남농업시험장 목포시험장 원예시험장 부산지장 -> 영남농업시험장 부산원예시험장
- 1995년
1995. 05
- 작물시험장 남양, 진부출장소 폐지
- 호남농업시험장 운봉출장소 폐지
- 고령지 농업시험장 감자과 -> 작물과
- 2002년
2002. 02
- 작물시험장 작물환경과 -> 환경생명공학과 신설
- 작물시험장 수도육종과 -> 벼유전육종과 개명
- 작물시험장 수도재배과 -> 벼재배생리과 개명